非免疫性胎儿水肿(NIHF)是一种以胎儿体内液体超负荷为特征的疾病,在个胎儿中就有一个胎儿可能出现这种情况,并且该疾病导致死产、早产和新生儿并发症或新生儿死亡的风险很高。妊娠期间,如果胎儿发生NIHF,则孕妇也有可能出现由一种称为“镜像综合征”的先兆子痫引起的并发症。NIHF是很多遗传性疾病的共同临床表现。使用核型分析或染色体微阵列分析仅能确定25%的NIHF病例的病因,并且无法检测单基因疾病。单基因疾病是否是引起NIHF的原因目前还尚不清楚,但其可能性比较大。一些表现为NIHF的遗传性疾病,仅有轻微的表型,长期预后较好,但有一些疾病却是致命性的。准确的诊断可以进行有针对性的产前管理和新生儿护理,以改善这类严重疾病的预后。本次研究的目的是确定外显子组测序在不明原因的NIHF中的诊断性能,并描述与NIHF相关的疾病谱。
结果研究参加者从年10月至年5月,我们共接受了例从全美各地转诊过来的NIHF病例。其中有例由于失访、拒绝参与后续研究、不符合纳入标准、用于外显子组测序的样本不足或通过其他检测方法(如核型分析、染色体微阵列分析或基因panel测序)已得到了诊断性结果等原因,在后续分析中被排除。最终有例病例进行了外显子测序(图一)。1.例接受外显子测序的参与者检测情况及样本来源如下:1)是否接受染色体核型分析及染色体微整列分析:4%(5例):仅接受了的染色体核型分析34%(43例):仅接受了染色体微阵列分析62%(79例):同时接受了染色体核型分析和染色体微阵列分析2)测序模式:90%(例):三联外显子测序(父-母-先证者)7%(9例):二联外显子测序(先证者+父母其中一方)2%(3例):四联外显子测序(先证者+先证者的一个兄弟姐妹+父+母)1%(3例):仅先证者外显子测序3)样本来源:21%(27例):绒毛膜穿刺绒毛57%(73例):羊膜穿刺术样本2%(2例):胎儿血样1%(1例):胸膜腔积液2%(3例):脐带血13%(17例):胎盘组织3%(4例):口腔拭子样本2.例参与者的人口统计学特征、表型特征和妊娠结局如下:在例参与者中,58%(74例)为白种人,15%(19例)为亚裔,14%(18例)为多种族混血,9%(12例)为西班牙裔或拉丁裔,2%(3例)为黑人,1%(1例)未知。在已完成妊娠过程的59位参与者中,有31%(18例)为活产婴儿。就入院时的产前表型而言,23%(29例)具有颈部透明层增厚或囊性湿疹,17%(21例)具有单个异常胎儿积液,61%(77例)具有两个及以上异常胎儿积液。在表1中,这些病例进一步分为仅有NIHF表型的孤立性病例和同时合并结构异常的病例。在15例孤立性颈部透明层增厚或囊性湿疹的病例中,颈部透明层厚度的中位数为5.0mm(四分位间距为3.9-7.0)。主要和次要结果我们在37例胎儿(29%)中发现了诊断性变异(根据ACMG和医学病理学协会的建议对遗传变异进行分类,归为致病性或可能致病性的变异被认为具有诊断性),这些变异导致了多种遗传疾病表型(表2和图2)。如图2中所示,在37例具有诊断性变异的胎儿中,影响RAS–MAPK细胞信号通路的疾病(又称RASopathies)占比最大(11例,30%);先天性代谢性疾病和肌肉骨骼疾病各占11%(各4例);淋巴、神经发育、心血管和血液系统疾病各占8%(各3例);最不常见的疾病是免疫性疾病(2例,5%);其次是肾脏疾病、纤毛病、过度生长综合征和其他疾病(各1例,各占3%)。诊断性变异(如表2所示)在检测到的37例具有诊断性变异中,大部分常染色体显性变异是新发的(88%),且36%是新变异,而大多数常染色体隐性变异是遗传的(95%),且80%都是新变异。具体情况如下:11例RASopathie主要包括努南综合征(由PTPN11,KRAS和RIT1的突变引起),努南样综合征伴早期毛发稀疏(SHOC2),心-面-皮肤综合征(BRAF)和Costello综合征(HRAS)。检测到的所有RASopathy变异都是新发变异,且都是以常染色体显性遗传模式致病。4例先天性代谢性疾病主要包括尼曼-匹克病C1型(NPC1),GM1神经节苷脂贮积症(GLB1)和VII型粘多糖贮积症(GUSB),所有这些都是常染色体隐性遗传,分别遗传自父母。4例肌肉骨骼疾病主要包括Nager综合征(SF3B4),I型肌痛性发育不良(FGFR3),杆状体肌病(KLHL40)和多发翼状胬肉综合征(MYH3)。SF3B4,FGFR3和MYH3变异都是常染色体显性遗传且均为新发突变。常染色体隐性遗传性杆状体肌病的KLHL40复合杂合变异分别遗传自父母。3例淋巴系统疾病(Milroy病,双行睫-淋巴水肿综合征和广泛性淋巴管发育不良)中,所有变异(FLT4,FOXC2和PIEZO1)均是遗传而来。FLT4和FOXC2变异均遗传自父母,他们的腿部和脚部有先前无法解释的轻度肿胀。3例神经发育障碍疾病,包括DeSanto-Shinawi综合征(WAC),Mowat-Wilson综合征(ZEB2)和链甾醇症(DHCR24)。WAC和ZEB2显性突变是新发突变,而常染色体隐性链甾醇症的两个变异均为遗传。3例血液系统疾病,包括1例Diamond–Blackfan贫血(RPL11)和2例脱水遗传性口形红细胞增多症(PIEZO1),都是常染色体显性遗传病。RPL11变异和一个PIEZO1变异都是新发变异,另一个PIEZO1变异是由可疑的母体嵌合所致。具有潜在临床意义的变异我们在个受影响的胎儿中有12个(9%)鉴定出了具有潜在临床意义的基因水平或变异水平证据的变异,但这些变异不符合致病性或可能的致病性评估标准。潜在的疾病包括RASopathy病,广泛性淋巴管发育不良,几种神经发育疾病等。例如与POU3F3相关的新兴发育迟缓性疾病,基因水平的证据不足。例如与ERCC5相关的脑-眼-面-骨骼综合征,基因-疾病相关性强,但变异水平的证据不足。另外有2例胎儿,仅在常染色体隐性遗传基因(CNTN1(北康普顿先天性肌病)和RYR1(致死性多发翼状胬肉综合征))上检测到了一个变异,该变异与表型一致,然而,未检测到另一个变异。次要发现总计,有91%的参与者家庭(个中的个)选择了接受次要发现。3%(名患者中的4名)分别在APOB(家族性高胆固醇血症),MYH7(家族性肥厚性心肌病),PTEN(PTEN错构瘤肿瘤综合征)和BRCA1(遗传性乳腺癌和卵巢癌综合征)几个基因中各有一个具有致病性或可能的致病性变异。讨论在例原因不明的NIHF胎儿中,有29%的病例通过使用外显子组测序检测出了诊断性变异。另外还在9%的病例中发现了具有潜在临床意义的变异,其中包括许多可能与表型有关的新变异或新基因。我们的阳性检出率远高于既往报道的8.5%和10%的诊断率,这些发现反映了单基因疾病在NIHF中起了重要作用。RASopathies在我们的研究中很常见。在既往研究中,努南综合征与NIHF的关系已经得到了很好的证实,但努南综合征以外的RASopathies的宫内表现目前还没有很好地描述。既往研究的产后病例中,大约一半的RASopathy变异是遗传的,但与此相反的是,我们研究中检测到的所有RASopathy变异多数为新发变异,且表型比较严重。
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