结膜炎是指结膜出现的炎症反应，是兽医临床上最常见的眼科疾病之一。
不常见，单纯性结膜炎是由各种刺激所引起，如异物、鼻泪管闭塞、药物和外伤等因素。
继发于各种传染病，如犬瘟热、疱疹病毒感染和犬立克次氏体等；以及继发于邻近组织疾病，如眼睑异常、角膜炎和干性角膜结膜炎。偶见注射疫苗、滴用某些眼药水引起的过敏性结膜炎。
犬继发性结膜炎：
1、细菌性感染：结膜囊内正常细菌过度增值，或者被眼睛周围的细菌所感染，多为葡萄球菌、绿脓杆菌和革兰氏阳性菌。
2、病毒性感染：病毒性疾病继发结膜炎，如犬瘟熟、犬腺病毒会造成结膜水肿和浆液黏液性甚至黏脓液性的排出物；犬疱疹病毒感染4-5天后也可能出现结膜炎。
3、寄生虫性结膜炎：犬中比较多见，特别是在夏季多发于经常外出的犬只。
4、过敏性及免疫性结膜炎：吸入花粉、尘螨或者其他过敏原导致异位性过敏反应时会出现泪溢和轻度的结膜发炎症状。
5、犬的结膜赘瘤和增生：鳞状细胞癌可能原发于结膜，也可能经由眼睑转移而来。其它较为罕见的有纤维肉瘤、乳突瘤、脂肪瘤、腺瘤、组织细胞瘤、血管瘤、血管肉瘤和肥大细胞瘤。
猫继发性结膜炎：
1、猫的传染性结膜炎：猫疱疹病毒I型是猫上呼吸道和眼睛表面感染常见的病因，特别是在幼猫时期。
2、披衣菌感染：猫的常见病原，主要造成结膜炎，但不会发生严重呼吸道感染。
3、嗜酸性球性角膜结膜炎：是一种猫特有的疾病，且或许是一种免疫性疾病。
4、猫的结膜团块及赘瘤：鳞状细胞癌、淋巴瘤及黑素瘤。